Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias

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PERFIL METABOLÔMICO SÉRICO DE PACIENTES NA FASE AGUDA DE CHIKUNGUNYA
Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
Tipo Tese
Data 06/10/2022
Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
Orientador(es)
  • James Venturini
Coorientador(es)
    Orientando(s)
    • Camila Amato Montalbano
    Banca
    • Adriana de Oliveira Franca
    • Ana Lucia Lyrio de Oliveira
    • James Venturini
    • Julio Henrique Rosa Croda
    • MARIO MACHADO MARTINS
    • PATRICIA VIEIRA DA SILVA
    • PAULA DE SOUZA SANTOS
    Resumo Chikungunya é um arbovírus de RNA que causa artralgia debilitante de duração prolongada. O presente estudo teve como objetivo identificar o perfil metabolômico sérico de pacientes durante a fase aguda da doença. Para tanto, foram incluídos 25 indivíduos com diagnóstico clínico-laboratorial para Chikungunya (CHIKV) (Grupo CHIKV+), 19 indivíduos com sintomatologia típica de chikungunya, porém com resultados laboratorial negativo para CHIKV (Grupo CHIKV-) e 15 indivíduos saudáveis (Grupo controle- CG). Os pacientes do Grupo CHIKV+ e do Grupo CHIKV- foram avaliados em dois momentos: Fase M0 (1 a 10 dias de sintomas) e Fase M1 (11 a 22 dias de sintomas). Esses pacientes foram ainda divididos em quatro subgrupos, de acordo com a intensidade da artralgia e se atingiram a cronicidade ou não: subgrupo Hight Severity (HS), subgrupo Mild to Moderate Severity (MMS), subgrupo Cronic (C) e subgrupo Non cronic (NC). As amostras séricas selecionadas foram submetidas à purificação com metanol e, em seguida, passaram pela Cromatografia Líquida de Alta Eficiência hifenado ao Espectrômetro de Massa (CLAEM/EM). Por fim, foi feita a identificação dos compostos e interpretação biológica dos achados em ferramentas adequadas. Os resultados revelaram 12 compostos lipídicos sub-regulados durante o M0 no CHIKV+ em relação ao CHIKV- e ao CG, sendo que muitos destes estão envolvidos na formação de membranas celulares, as quais são importantes para cada parte dos ciclos de vida de flavivírus e togavírus, incluindo entrada, replicação, montagem e saída. Sendo assim, o CHIKV utiliza demasiadamente estes lipídios dentro das células, havendo esgotamento no soro. Dez lipídios desses mantém seus níveis reduzidos no M1 demonstrando que o vírus continua utilizando lipídios em favor a sua perpetuação. O 17-phenyl trinor PGF2α-AS é um biomarcador de dor do momento inicial de fase aguda e de cronificação. A sub-regulação do composto Gln Arg Phe foi identificado como biomarcador de cronicidade. A descoberta destas alterações metabólicas pode levar a elucidação de fatores da fisiopatologia da doença, sendo útil para melhor compreensão desta, o que pode melhorar o manejo dos doentes, oferecendo-lhes melhor qualidade de vida durante o tratamento e evitar as fases subsequentes desta enfermidade.

    Palavras-chave: chikungunya, fase aguda, análise metabolômica.
    INFECÇÃO PELO HIV: PREVALÊNCIA, PrEP E A TECNOLOGIA A FAVOR DE ESTRATÉGIAS DE PREVENÇÃO
    Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
    Tipo Tese
    Data 30/09/2022
    Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
    Orientador(es)
    • Ana Rita Coimbra Motta de Castro
    Coorientador(es)
      Orientando(s)
      • Gabriela Alves Cesar
      Banca
      • Ana Rita Coimbra Motta de Castro
      • Ana Tereza Gomes Guerrero
      • ANDREA FACHEL LEAL
      • Clarice Souza Pinto
      • Grazielli Rocha de Rezende
      • Tayana Serpa Ortiz Tanaka
      Resumo O combate à epidemia causada pela infecção pelo vírus da imunodeficiência humana (HIV) é contínuo e atemporal. No Brasil, a epidemia está concentrada em alguns grupos populacionais que estão em risco aumentado de aquisição da infecção pelo HIV. Com base nessas informações, o Ministério da Saúde disponibilizou estratégias voltadas à prevenção da infecção pelo HIV, chamada Prevenção Combinada, e dentre elas encontra-se a Profilaxia Pré-Exposição (PrEP) oral. A PrEP consiste no uso de antirretrovirais diários que previnem a infecção pelo HIV mesmo em casos de exposição a esse vírus. De novembro de 2011 a setembro de 2013, foi conduzido o primeiro estudo abordando os aspectos epidemiológicos e moleculares da infecção pelo HIV em homens que fazem sexo com homens (HSH), mulheres transgênero e travestis (TW) em Campo Grande-MS. Anos mais tarde, diante da elevada prevalência da infecção pelo HIV em HSH e TW, da necessidade urgente de diminuir o número de novos casos de HIV e da disponibilidade de PrEP no Brasil, um segundo estudo transversal foi conduzido com o objetivo de avaliar os dados sociodemográficos e a taxa de incidência de infecções sexualmente transmissíveis (IST) na população usuária de PrEP atendida no Centro de Testagem e Aconselhamento (CTA) em Campo Grande, Mato Grosso do Sul. Para alcançar os objetivos do terceiro estudo, um software foi desenvolvido com informações gerais sobre PrEP, que visam a melhoria da qualidade de vida, adesão e uso racional da PrEP pelo usuário. O primeiro estudo foi conduzido com 430 participantes, sendo 278 HSH e 152 TW. A prevalência da infecção pelo HIV nesta população foi de 9% (25/278) entre os HSH e 24,3% (37/152) entre as TW. Após a análise uni e multivariada, ter idade maior ou igual a 30 anos foi associada à infecção pelo HIV nos HSH. Enquanto para o grupo das TW, as variáveis associadas foram: ter sido forçado a ter relações sexuais com alguém, coinfecção HIV e sífilis e coinfecção HIV e hepatite C (HCV). Em relação às análises filogenéticas, 65% das sequências foram classificadas como subtipo B. No segundo estudo, foram incluídos 261 usuários de PrEP, a maioria com idade variando de 18 a 30 anos e do sexo biológico masculino (92,7%). Em relação a identidade de gênero, 84,6% eram gays ou HSH, 7,6% eram mulheres transgênero e 7,6% eram mulheres cisgênero. Foram identificados 31/261 novos casos de sífilis ativa, com uma taxa de incidência de 11,8 por 100 pessoas/ano. Novos casos de HIV (7/261) e novos casos de coinfecção HIV e sífilis (3/261 ) também foram encontrados. Entre os usuários de PrEP estudados, histórico de contato sexual com pessoa de mesmo sexo permaneceu associado aos novos casos de IST. Com relação ao desenvolvimento do software, o Instituto Nacional de Propriedade Industrial expediu os certificados de registro de programa de computador, de números BR 51202101589-4; BR 5120211590-8 e BR 512021001591-6. Os resultados demonstram uma elevada prevalência de infecção pelo HIV em HSH e TW quando comparada com as taxas observadas na população em geral. Apesar de mais expostos ao risco de infecção, jovens e gays/HSH constituem a maioria da população usuária de PrEP, ressaltando a urgente necessidade de políticas de saúde pública específicas que aumentem a participação das mulheres e mulheres transsexuais com relação ao diagnóstico, tratamento e medidas de prevenção. O desenvolvimento de novas tecnologias pode contribuir para o monitoramento, adesão e uso racional da PrEP, visando assim a redução de novos casos de infecção pelo HIV.

      Palavras-chave: HIV, Prevenção combinada, Profilaxia Pré-Exposição (PrEP).
      ASPECTOS HEMATOLÓGICOS E REGULAÇÃO DO METABOLISMO DO FERRO NA PARACOCCIDIOIDOMICOSE
      Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
      Tipo Tese
      Data 28/09/2022
      Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
      Orientador(es)
      • Anamaria Mello Miranda Paniago
      Coorientador(es)
        Orientando(s)
        • Eliana da Costa Alvarenga de Brito
        Banca
        • Adriana de Oliveira Franca
        • Anamaria Mello Miranda Paniago
        • Claudia Elizabeth Volpe Chaves
        • Eduardo Benedetti Parisotto
        • Eliane Borges de Almeida
        • Jeniffer Michelline de Oliveira
        • Rinaldo Poncio Mendes
        Resumo Paracoccidioidomicose (PCM) é uma micose sistêmica, causada por fungos do gênero Paracoccidioides spp., que pode provocar alterações hematológicas e no metabolismo do ferro e está relacionada à resposta inflamatória do hospedeiro. Assim, anemia, leucocitose, eosinofilia e linfocitose têm sido descritas, principalmente na forma aguda/subaguda da doença. As alterações hematológicas e no metabolismo do ferro na forma crônica da PCM são pouco conhecidas. O objetivo deste estudo foi analisar e interpretar os aspectos hematológicos, bem como o metabolismo do ferro em diferentes compartimentos e avaliar a hepcidina sérica em pacientes com a forma crônica da PCM durante o processo de cura. Foram realizados três estudos, desenvolvidos no Hospital Dia Professora Esterina Corsini na Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Com indivíduos diagnosticados com a forma crônica da PCM nos anos de 2013 a 2021. No primeiro estudo, com o propósito de contribuir com o conhecimento sobre as alterações das células hematológicas na forma crônica da PCM e no monitoramento do tratamento, avaliou-se o hemograma de pacientes com PCM crônica antes do início e durante diferentes estágios do tratamento. Os 62 pacientes incluídos tinham média de idade de 54,3 (DP 6,9) anos, sendo predominantemente homens (96,8%) e trabalhadores rurais (88,7%). Notou-se que na PCM crônica, as alterações no hemograma foram principalmente anemia e monocitose, no entanto, as alterações não são exuberantes. Após o tratamento, principalmente ao atingir a cura clínica, a maioria dos índices hematológicos alteram-se significativamente refletindo a interferência da infecção nestes parâmetros. No segundo estudo, com o intuito de compreender quais e quão intensos são os distúrbios no metabolismo do ferro em pacientes com forma crônica de PCM analisou-se os diferentes compartimentos de ferro, antes do tratamento e após a cura clínica. Notou-se que a PCM altera os compartimentos de estoque e funcional do ferro, sem alterar o compartimento de transporte. Apesar de que antes do tratamento as medidas centrais (média ou mediana) de ferritina, hemoglobina, eritrócitos, hematócrito e ferro sérico estavam normais, notou-se uma redução dos níveis de ferritina e aumento dos outros parâmetros entre o início do tratamento e a cura clínica. Além disso, observou-se que as alterações dos compartimentos de estoque e funcional do ferro apresentaram uma associação com a gravidade do quadro da doença. Os parâmetros do compartimento funcional apresentaram correlação negativa com a proteína C reativa, deste modo, foi possível inferir que a PCM interfere no metabolismo do ferro por transferir ferro do compartimento funcional para o de estoque, caracterizando uma anemia de inflamação. O terceiro estudo analisou os níveis de hepcidina sérica em pacientes com a forma crônica da PCM antes e durante o tratamento. Correlacionou-se a hepcidina com parâmetros do metabolismo do ferro e com as células sanguíneas. Apesar do aumento de hemoglobina e ferro e redução de ferritina observados entre antes do tramento e em cura clínica, não houve redução nos níveis de hepcidina, como era esperado. No entanto, observou-se correlação direta com células leucocitárias (r = 0,483; p = 0,001), neutrófilos (r = 0,418; p = 0,006), monócitos (r = 0,396; p = 0,009) - duas células fagocitárias que atuam na primeira linha de defesa da PCM e são sabidamente produtoras de hepcidina. Em síntese, a forma crônica da PCM cursa com alterações no metabolismo do ferro e nas células hematológicas, que de modo geral, estão associadas com a gravidade da doença e melhoram após o tratamento.
        FIBROGÊNESE PULMONAR NA PARACOCCIDIOIDOMICOSE: COMPARAÇÃO DO PERFIL PROTÊOMICO DE DIFERENTES MODELOS EXPERIMENTAIS DE FIBROSES PULMONAR E HEPÁTICA .
        Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
        Tipo Tese
        Data 18/08/2022
        Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
        Orientador(es)
        • James Venturini
        Coorientador(es)
          Orientando(s)
          • Amanda Ribeiro dos Santos
          Banca
          • Anamaria Mello Miranda Paniago
          • Bárbara Casella Amorim
          • Gil Benard
          • Giovana Cristina Giannesi
          • James Venturini
          • Marcia de Souza Carvalho Melhem
          • Ricardo de Souza Cavalcante
          Resumo Introdução. A paracoccidioidomicose (PCM) é uma micose sistêmica causada por fungos do gênero
          Paracoccidioides. É uma doença endêmica na América Latina, sendo a primeira causa de morte entre todas as micoses sistêmicas no Brasil. Essa doença afeta principalmente os trabalhadores rurais e induz sequelas graves, incluindo a fibrose pulmonar (FP) e o enfisema pulmonar. De modo geral, a fibrogênese é caracterizada pela hiperplasia de miofibroblastos e intensa deposição de colágeno no parênquima e em vasos sanguíneos. Com o tempo, esse processo induz mudanças na arquitetura do órgão afetado induzindo o declínio da função. Em geral, o conhecimento dos mecanismos envolvidos na fibrogênese é baseado em estudos, por exemplo, de fibroses hepática (FH) e pulmonares não infecciosas, como a fibrose pulmonar idiopática (FPI). Na PCM, os mecanismos envolvidos na FP ainda permanecem pouco esclarecidos. Objetivo. Identificar vias de sinalizações relevantes para a FP na PCM experimental através da comparação do proteoma pulmonar de camundongos infectados
          com P. brasiliensis e camundongos com FP induzida por bleomicina (BLM), bem como proteínasalvo relevantes que sejam comuns nos modelos de FP (PCM e BLM) e no modelo de FH induzida
          por tetracloreto de carbono (CCl4). Metodologia. O modelo de FP-PCM foi constituído por
          camundongos da linhagem BALB/c, adultos, machos, inoculados com leveduras de P. brasiliensis
          (isolado Pb326) pela via intra-traqueal e foram avaliados após oito semanas. O modelo de FP-BLM
          foi constituído por camundongos BALB/c, adultos, machos, nos quais foram administradas três doses
          de bleomicina pela via intraperitoneal e foram avaliados após duas semanas da última dose. O modelo
          de FH foi constituído por camundongos da linhagem C57Bl/6, adultos, machos, nos quais foram
          administradas 12 doses de CCl4, intraperitonealmente, duas vezes por semana durante seis semanas.
          Os grupos controles foram constituídos por camundongos BALB/c e C57Bl/6 submetidos às mesmas
          condições de inóculos, utilizando-se solução salina estéril. Pulmões e fígado foram coletados de
          acordo com cada modelo e foram submetidos a análise histopatológica e recuperação de fungos
          viáveis para o modelo FP-PCM. A análise proteômica foi realizada utilizando nano-cromatografia
          líquida acoplada ao espectrofotômetro de massas de ionização por electrospray (nano-LC-ESI-MS /
          MS). O software Protein Lynx Global Service (PLGS) foi usado para identificar a diferença na
          expressão das proteínas identificadas, onde p <0.05 e 1 - p> 0.95, foram usados para a determinação
          de proteínas sub- ou super expressas respectivamente. Análises de bioinformática foram realizadas
          para a identificação das vias significantemente enriquecidas nas quais as proteínas com expressão
          similar ou diferentes entre os grupos participavam. Para esta análise, o banco de dados de vias
          Reactome foi utilizado através do Cluego v2.0.7 + Clupedia v1.0.8 plug-in no software Cytoscape.
          Resultados e discussão. A análise proteômica revelou 919 proteínas diferencialmente expressas entre
          os pulmões do modelo FP-PCM e o pulmão saudável do grupo controle. Foi observado, ainda, que a
          infecção por P. brasiliensis induziu super expressão em vias relacionadas com sinalizações prófibróticas, incluindo: resposta neutrofílica, resposta celular ao estresse, resposta pró-fibrótica mediada
          pela sinalização do receptor TGF-β na transição celular de epitelial para mesenquimatosa, fase de
          atenuação e fenótipo secretor associado à senescência, degranulação plaquetária e sinalização PI3K.
          Foram identificadas 355 proteínas em comum com os três modelos de fibroses avaliados. A análise
          do padrão de expressão dessas proteínas através de heatmap revelou que a fibrogênese observada na
          PCM experimental apresentou maior similaridade entre as proteínas diferencialmente expressas pelo
          modelo de FH induzida por CCl4. As proteínas Rho GTPases, HSP-90 e vimentina estavam super
          expressas nos tecidos fibróticos desses dois grupos. Conclusão. Nossos achados contribuem para
          identificar mecanismos moleculares mais específicos envolvidos na fibrogênese da PCM, bem como identificar alvos proteicos para possíveis drogas anti-fibróticas na PCM.
          FATORES DE RISCO PARA ÓBITO PELA COVID-19 E EFETIVIDADE DAS VACINAS CORONAVAC E CHADOX1 FRENTE A VARIANTE GAMA NO BRASIL
          Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
          Tipo Tese
          Data 25/05/2022
          Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
          Orientador(es)
          • Julio Henrique Rosa Croda
          Coorientador(es)
            Orientando(s)
            • Patrícia Vieira da Silva
            Banca
            • Ana Lucia Lyrio de Oliveira
            • James Venturini
            • Julio Henrique Rosa Croda
            • Karla Regina Warszawski de Oliveira
            • Marco Antonio Moreira Puga
            • Rivaldo Venancio da Cunha
            • Roberto Dias de Oliveira
            Resumo Em dezembro de 2019, um surto de pneumonia de origem desconhecida foi relatado
            na China. O agente etiológico foi identificado como coronavírus causador da síndrome
            respiratória aguda grave 2 (SARS-CoV-2) e a doença nomeada como doença do novo
            coronavírus 2019 (COVID-19). O vírus se espalhou por todo mundo e no Brasil foram
            registrados mais de 30 milhões de casos e 663 mil mortes. Números altamente
            desproporcionais de mortes foram identificados entre alguns grupos, levando a
            necessidade de elucidar quais fatores de risco estão associados a desfechos graves
            pela COVID-19. As vacinas contra o SARS-CoV-2 foram desenvolvidas,
            comprovadamente eficazes e implantadas em campanhas de vacinação em massa.
            Destacam-se entre elas, as duas primeiras vacinas distribuídas no Brasil, a
            CoronaVac e a ChAdOx1. O surgimento das variantes de preocupação (VOCs), como
            a variante Gama, criou a necessidade do monitoramento contínuo da efetividade das
            vacinas, uma vez que mutações observadas nessas variantes podem conferir escape
            a imunidade e neutralização dos imunizantes. Diante do exposto, este estudo teve
            como objetivo descrever os fatores de risco para óbito pela COVID-19 e estimar a
            efetividade das duas primeiras vacinas frente a variante Gama no Brasil. Diferentes
            metodologias foram utilizadas neste estudo. Para identificar os fatores de risco para
            óbito, foi realizada uma análise de sobrevida com todos os pacientes internados com
            COVID-19 confirmada por RT-PCR no estado de São Paulo cadastrados no Sistema
            de Vigilância Epidemiológica da Gripe (SIVEP-GRIPE) no período de 26 de fevereiro
            de 2020 a 10 de outubro de 2020. Para o estudo de efetividade foi realizado um casocontrole
            pareado com teste negativo, comparando os casos de COVID-19 confirmada
            por RT-PCR, hospitalização e óbito, em idosos durante a epidemia com alta
            prevalência da variante Gama no estado de São Paulo, com as doses aplicadas da
            CoronaVac e ChAdOx1. Observamos que homens, idosos, e pessoas com
            comorbidades tiveram maior risco de óbito pela COVID-19. A efetividade ajustada da
            CoronaVac contra COVID-19 sintomática foi de 24,7% em 0-13 dias e 46,8% em ≥14
            dias após a segunda dose. Já a efetividade ajustada contra internações foi de 55,5%
            e contra óbitos foi de 61,2% ≥14 dias após a segunda dose. A efetividade da
            CoronaVac diminuiu com o aumento da idade. A partir de 28 dias após a primeira
            dose, a efetividade da ChAdOx1 foi de 33,4% contra COVID-19 sintomática, 55,1%
            contra hospitalização e 61,8% contra óbito. A partir de 14 dias após a segunda dose,
            a efetividade do esquema de duas doses da ChAdOx1 foi 77,9% contra COVID-19,
            87,6% contra hospitalização e 93,6% contra óbito. De acordo com os resultados
            obtidos, pessoas que apresentam fatores de risco para agravamento da infecção
            devem ser priorizadas na vacinação, afim de diminuir a mortalidade pela COVID-19.
            Além disso, a conclusão do cronograma vacinal de duas doses com CoronaVac e
            ChAdOx1 oferece proteção contra casos leves e graves da COVID-19 em idosos
            durante a circulação generalizada da variante Gama.
            ASPECTOS SOROEPIDEMIOLÓGICOS E MOLECULARES DAS HEPATITES A e E EM DIFERENTES GRUPOS POPULACIONAIS NOS ESTADOS DE SÃO PAULO E MATO GROSSO DO SUL
            Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
            Tipo Tese
            Data 30/03/2022
            Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
            Orientador(es)
            • Ana Rita Coimbra Motta de Castro
            Coorientador(es)
              Orientando(s)
              • Sabrina Moreira dos Santos Weis Torres
              Banca
              • Ana Rita Coimbra Motta de Castro
              • Bárbara Vieira do Lago
              • Grazielli Rocha de Rezende
              • James Venturini
              • Larissa Melo Bandeira
              • Roosecelis Brasil Martines
              • Vanessa Salete de Paula
              Resumo O objetivo deste estudo foi caracterizar os aspectos soroepidemiológicos e moleculares das infecções causadas pelos vírus das hepatites A (HAV) e E (HEV) em diferentes grupos populacionais de Mato Grosso do Sul (MS) e de São Paulo (SP). Em MS, os grupos populacionais estudados foram: doadores de sangue (BD), comunidades afrodescendentes (AFD), imigrantes japoneses e seus descendentes (JMS), catadores de materiais recicláveis (PC), privados de liberdade (PPL), privados de liberdade com tuberculose ativa (PTB), homens que fazem sexo com homens (HSHMS), mulheres trans (TW), pacientes com hepatite C crônica (PHCV) e pessoas vivendo com HIV/aids (PVHA). Em SP, o presente estudo foi conduzido na população de imigrantes japoneses e seus descendentes (JSP). Além disso, visou-se estimar as taxas de sororreversão e de incidência da infecção pelo HEV em população privada de liberdade (PPL). Foram testadas 3243 amostras para pesquisa de marcadores sorológicos da infecção pelo HAV (anti-HAV total e/ou IgM) por meio de ensaio imunoquimioluminescente (VITROS Eci) e um total de 5301 amostras foram submetidas à detecção dos marcadores de exposição ao HEV (anti-HEV IgG e IgM) utilizando ensaio imunoenzimático (WANTAI HEV ELISA kit). Após extração, o RNA viral das amostras anti-HEV IgM positivas foi amplificado por RT-qPCR. A prevalência do marcador anti-HAV total encontrada neste estudo foi de 78,6% (95% IC: 77,1 – 79,9). A maior prevalência foi observada na população de PC (96,4%), seguida por PVHA (95,0%), PHCV (93,8%), PTB (85,2%), JMS (78,9%), JSP (69,5%) e AFD (66,9%). Os fatores associados à presença de anti-HAV total nos grupos populacionais de MS foram: idade maior que 30 anos (AFD e JMS), ter baixa escolaridade (PC, PTB), ter parceiro sexual fixo (JMS), uso irregular do preservativo (AFD), ser do sexo feminino e ter sido recrutado no lixão (PC). Em São Paulo (população JSP) os fatores associados à essa infecção foram: ter idade maior que 30 anos, não ter nascido em São Paulo, ser imigrante ou filho de imigrante japonês, não ser descendente de okinawanos e não ter tatuagem. Das 1010 amostras testadas para o marcador anti-HAV-IgM somente uma amostra foi positiva. A prevalência de exposição ao HEV encontrada neste estudo foi de 9,8% (95% IC: 9,0 – 10,7). Apenas 50 participantes apresentaram positividade ao anti-HEV-IgM (1,1%), dos quais apenas um apresentou RNA de HEV detectável e pertencia à população AFD. A maior prevalência de infecção pelo HEV foi encontrada na população PC (14,8%), seguida por PPL (14,6%), PTB (12,9%), PVHA (9,4%), JSP (8,9%), HSHMS (8,2%), TW (8,1%), PHCV (7,4%), AFD (6,7%), BD (6,4%) e JMS (6,0%). Os fatores associados à presença dos marcadores de exposição ao HEV nas populações estudadas foram: idade maior que 30 anos (PTB, JSP), não ter nascido no MS (BD e PC), baixa escolaridade (PPL, HSHMS), uso regular do preservativo (PTB) e uso de heroína (PPL). A taxa de incidência de infecção pelo HEV em privados de liberdade foi de 1,0/100 pessoas-ano, e a taxa de sororreversão foi de 7,8/100 pessoas-ano. Esses dados indicam elevada prevalência de marcadores anti-HAV na maioria das populações estudadas, apesar da existência de indivíduos jovens suscetíveis à essa infecção nas populações de JMS, JSP e AFD. Recomenda-se, portanto, a elaboração de estratégias adequadas e acessíveis de vacinação contra hepatite A nestes grupos populacionais. Os dados epidemiológicos da infecção pelo HEV nos grupos populacionais estudados demonstram que as prevalências podem variar de acordo com a população estudada e evidenciam a ocorrência de novos casos (soroconversão), bem como sororreversão dos marcadores de infecção pelo HEV em ambientes prisionais. Além disso, as informações geradas a partir desta pesquisa podem contribuir para maior conhecimento dessas infecções no Brasil, ressaltando a importância de delineamento de intervenções em saúde pública mais específicas e direcionadas aos diferentes grupos populacionais.
              EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR DO HIV-1 E INFECÇÃO PELO VÍRUS DA HEPATITE E EM POPULAÇÃO PRIVADA DE LIBERDADE DE MATO GROSSO DO SUL
              Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
              Tipo Tese
              Data 18/02/2022
              Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
              Orientador(es)
              • Ana Rita Coimbra Motta de Castro
              Coorientador(es)
                Orientando(s)
                • Tayana Serpa Ortiz Tanaka
                Banca
                • Ana Rita Coimbra Motta de Castro
                • Bárbara Vieira do Lago
                • Diogo Gama Caetano
                • Grazielli Rocha de Rezende
                • Marco Antonio Moreira Puga
                • Victor Figueiredo Pimentel
                Resumo A população privada de liberdade (PPL) enfrenta dificuldades em obter o diagnóstico precoce, o tratamento em momento oportuno, e a aderir ao tratamento para várias doenças transmissíveis. Por isso, nesse subgrupo populacional, ainda se observam prevalências alarmantes de doenças transmissíveis, como as infecções causadas pelos vírus da imunodeficiência humana (HIV) e coinfecção pelo vírus da hepatite E (HEV). Por isso, o presente estudo teve como objetivo identificar a variabilidade genética do HIV-1 circulante, verificar a ocorrência de redes de transmissão do HIV-1 e descrever as principais mutações associadas à resistência aos antirretrovirais presentes no gene da polimerase (protease e transcriptase reversa) e possíveis fatores sociocomportamentais associados a estas na PPL infectada pelo HIV-1 (artigo 1). No artigo 2, visou-se estimar a prevalência da coinfecção pelo vírus da hepatite E (HEV), bem como identificar os fatores associados à essa coinfecção nessa população. A população-alvo do estudo foi composta por indivíduos privados de liberdade (IPL) de Mato Grosso do Sul (MS), previamente diagnosticados como infectados pelo HIV-1 na ocasião de estudos anteriores e de busca ativa em estabelecimentos prisionais, contabilizando um total de 103 indivíduos. Para o artigo 1, o DNA proviral foi extraído das amostras de sangue total de 100 indivíduos para os quais tínhamos material biológico armazenado e fragmento parcial da polimerase foi amplificado por nested-PCR em 93 destes. Os produtos purificados dos isolados virais foram submetidos ao sequenciamento nucleotídico por Sanger para identificação de mutações de resistência, classificação dos subtipos do HIV-1 e verificação da ocorrência de grupos de transmissão, por meio da análise filogenética combinada ao cálculo de distância genética. Sete amostras foram excluídas por estarem duplamente amostradas e duas, devido ao sequenciamento incompleto. Assim, resultados moleculares de 84 indivíduos permitiram caracterizar 49 (58,3%) como pertencentes ao subtipo B do HIV-1, 12 (14,3%) ao C, 1 ao D (1,2%),1 (1,2%) ao F1 e formas recombinantes foram detectadas em 21 (25,0%). Dos 84 indivíduos, 50 (59,5%) faziam uso de antirretrovirais, enquanto 34 (40,5%) eram virgens de tratamento antirretroviral. Entre os previamente tratados, mutações de resistência aos antirretrovirais foram encontradas em 32,0% (16/50), sendo que 6,0% dos indivíduos apresentavam múltiplas mutações principalmente a NNRTI e NRTI . Entre aqueles virgens de tratamento antirretroviral, 5,9% (2/34) apresentavam mutações relacionadas à resistência. Foram detectados quatorze clusters entre sequências obtidas da PPL e/ou sequências obtidas da base de dados de Los Alamos, com uma média de 3,5 sequências/cluster. Ser homem que faz sexo com homens (HSH) aumenta a chance de formar um cluster em 9,38 vezes (IC95% 1,59-55,25) e ser infectado por subtipo não-B é fator protetor para a formação de cluster. As redes indicam que a PPL pode estar influenciando na transmissão não apenas dentro das prisões, mas também na comunidade fora delas. O artigo 2 teve como objetivo estimar a prevalência da coinfecção HEV-HIV, para tal foram utilizados kit comerciais para detecção qualitativa de anti-HEV IgG e IgM, por ensaio imunoenzimático. Dos 104 indivíduos triados para detecção da coinfecção HEV-HIV, 14 (13,5%; IC95%: 8,1-21,6) IPL apresentavam anti-HEV IgG e 5 (4,8%; IC95%: 2,0-11,2) anti-HEV IgM, sendo estas altas prevalências similares às encontradas em pessoas vivendo com o HIV em outras cidades brasileiras. Em conjunto o aprimoramento do conhecimento da PPL, com diagnóstico precoce de infecções virais e seguida de início precoce de tratamento pode limitar a dinâmica de transmissão destes vírus, e ajudar a delinear intervenções de saúde pública mais específicas a esses cenários.
                DISTRIBUIÇÃO ESPAÇO-TEMPORAL DE FLEBOTOMÍNEOS E DA LEISHMANIOSE VISCERAL EM ÁREA DE TRANSMISSÃO INTENSA, CAMPO GRANDE, MS, BRASIL
                Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
                Tipo Tese
                Data 09/07/2021
                Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
                Orientador(es)
                • Alessandra Gutierrez de Oliveira
                Coorientador(es)
                  Orientando(s)
                  • Wagner de Souza Fernandes
                  Banca
                  • Alessandra Gutierrez de Oliveira
                  • Andrey José de Andrade
                  • Eunice Aparecida Bianchi Galati
                  • Mirella Ferreira da Cunha Santos
                  • Reginaldo Peçanha Brazil
                  • Renato Andreotti e Silva
                  Resumo As perturbações no ambiente causadas pela abertura desordenada de novas áreas para atender
                  a crescente demanda da população, incluindo aquelas com baixas condições socioeconômicas
                  e que vivem em precárias condições sanitárias, favorecem a emergência ou reemergência de
                  diversas doenças transmitidas por vetores, como as leishmanioses. A cidade de Campo Grande,
                  localizada na porção Centro-Oeste do Brasil, é classificada como área de transmissão intensa
                  para leishmaniose visceral (LV), com as primeiras notificações em 2001, seguida de franca
                  expansão na área nos anos seguintes. O presente estudo teve como objetivo identificar a
                  distribuição espaço-temporal de flebotomíneos e da LV na cidade de Campo Grande, Mato
                  Grosso do Sul e entender como a urbanização alterou a fauna local desses dípteros. Foram
                  utilizados dados primários da fauna obtidos através de coletas sistemáticas realizadas com o
                  auxílio de armadilhas automáticas luminosas instaladas a cada quinze dias em dezesseis bairros,
                  de julho de 2017 a junho de 2019. Foram ainda utilizados dados secundários de trabalhos
                  realizados na área urbana entre os anos de 1999 e 2000 e de 2003 a 2005. O Índice de Vegetação
                  por Diferença Normalizada (NDVI) foi utilizado para calcular a porcentagem de área
                  urbanizada entre 1999 e 2017 e os dados das variáveis climáticas para avaliar a influência dos
                  fatores abióticos na abundância e distribuição desses insetos. Para avaliar a distribuição de LV
                  foi calculada a incidência e descrição das características demográficas da população. Os casos
                  notificados foram geocodificados e agrupados por bairro para estimar riscos relativos
                  suavizados e avaliados de acordo com a análise de dados de área usando Modelo Aditivo
                  Generalizado. Entre 2017 e 2019 foram capturados 1572 flebotomíneos pertencentes a quatro
                  espécies: Bichromomyia flaviscutellata, Evandromyia lenti, Lutzomyia longipalpis e
                  Nyssomyia whitmani. Observou-se redução em cerca de 85% das espécies previamente
                  encontradas na cidade. Lutzomyia longipalpis, com 99,4% foi a espécie mais frequente e
                  dominante. A frequência da espécie apresentou correlação com as médias de temperatura,
                  umidade e velocidade do vento e a sazonalidade observada reflete o risco de infecção por
                  Leishmania (Leishmania) infantum ao longo do ano na área urbana. Os ambientes amostrados
                  apresentaram aumento de áreas urbanizadas nos últimos 20 anos. Em consonância com os
                  demais resultados, evidenciou-se a rápida transição de área epidêmica para endêmica e o padrão
                  de dispersão centrífuga da LV em Campo Grande, e que o índice de qualidade de vida urbana,
                  calculado com base em dados de renda, escolaridade, condições de moradia e saneamento
                  ambiental são determinantes na ocorrência da doença. Enfatizamos que compreender a relação
                  de flebotomíneos com as mudanças ambientais e as condições socioeconômicas de uma
                  população são essenciais para entender a dinâmica das leishmanioses, buscando fornecer
                  subsídios para propor e implementar medidas de prevenção e controle da doença.
                  PREVALÊNCIA DE ASPERGILOSE PULMONAR CRÔNICA EM PACIENTES COM TUBERCULOSE
                  Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
                  Tipo Tese
                  Data 24/03/2021
                  Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
                  Orientador(es)
                  • Anamaria Mello Miranda Paniago
                  Coorientador(es)
                    Orientando(s)
                    • Claudia Elizabeth Volpe Chaves
                    Banca
                    • Anamaria Mello Miranda Paniago
                    • Antonio José Grande
                    • Marcello Mihailenko Chaves Magri
                    • Marcia de Souza Carvalho Melhem
                    • Paulo de Tarso Guerrero Muller
                    • Rinaldo Poncio Mendes
                    Resumo Aspergilose pulmonar crônica (APC) é uma doença fúngica negligenciada, com alta morbidade e mortalidade e as alterações anatômicas induzidas pela tuberculose pulmonar (TBP) são o principal fator predisponente. O seu diagnóstico é um desafio e a sua prevência pouco conhecida e provavelmente, subestimada pela ausência de métodos diagnósticos mais acurados. Além dos exames microbiológicos, testes sorológicos como imunodifusão dupla em gel de ágar (IDD) ou contraimunoeletroforese (CIE) são ainda utilizados na rotina diagnóstica de APC. Mais recentemente o ELISA vem sendo utilizado como teste alternativo. O objetivo deste estudo foi avaliar a prevalência de APC em pacientes com TBP em dois serviços de saúde, em Campo Grande, Mato Grosso do Sul e a acurácia dos testes sorológicos para o seu diagnóstico. Foram realizados dois estudos. O primeiro estudo foi uma revisão sistemática com objetivo de comparar a acurácia do teste ELISA com o teste de referência (IDD e/ou CIE) para o diagnóstico de APC. O estudo foi conduzido de acordo com “Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyzes” (PRISMA). Nós realizamos a pesquisa nas bases eletrônicas MEDLINE (PubMed), EMBASE (Elsevier), LILACS (VHL), Cochrane library, and ISI Web of Science. Foram incluídos 14 artigos com casos de APC que foram submetidos aos dois testes: ELISA (teste índice) e IDD e/ou CIE (testes de referência) e que avaliaram a acurácia dos testes, mas somente quatro puderam ser metanalisados. Não encontramos diferença significativa em sensibilidade e especificidade nos 4 estudos metanalisados inicialmente, com uma moderada e alta heterogeneidade, respectivamente. Quando analisamos dois estudos com testes comerciais, as sensibilidades agrupadas foram de 0.95 (95% CI 0.93–0.97) e 0.49 (95% CI 0.45–0.54) respectivamente, para o teste ELISA e IDD/CIE, com nenhuma heterogeneidade. O segundo estudo foi transversal analítico com pacientes com TBP atendidos no ambulatório de Hospital Universitário Maria Aparecida Pedrossian (HUMAP) ou admitidos no Hospital Regional de Mato Grosso do Sul (HRMS) em Campo Grande, Mato Grosso do Sul, entre fevereiro de 2016 a novembro de 2019. Para estimar a prevalência de APC nessa população, 193 pacientes consecutivos elegíveis foram incluídos no estudo. Foram submetidos à avaliação clínica, tomográfica, exames de escarro e sorologias pelo teste ELISA e IDD. A prevalência global de APC foi de 10,9%. Ter tido TBP há 4 anos ou mais e apresentar hemoptise foram mais frequentes em pacientes com APC, com odds ratio de 17.54 (1.85-166.67) e 9.61 (2.21-41.67), respectivamente. Cavitações, espessamento pleural e presença de bola fúngica foram as alterações tomográficas mais frequentes em APC. Considerando os casos de APC confirmados e 100 doadores de sangue saudáveis, não houve diferença significativa na avaliação de sensibilidade e especificidade, porém o teste de ELISA apresentou um desempenho melhor do que o teste IDD na avaliação do teste de Youden. A frequência de óbitos entre os pacientes com APC foi de 28,6%. Esses achados indicam a necessidade de vigilância contínua de APC em pacientes com TBP desde o tratamento e ao longo da vida, com avaliação clínica, tomográfica e sorológica, preferencialmente pelo método ELISA que demonstrou um melhor desempenho no diagnóstico de APC.

                    ANTIGENEMIA CRIPTOCÓCCICA EM PACIENTES COM AIDS E IMUNOSSUPRESSÃO GRAVE
                    Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
                    Tipo Tese
                    Data 07/10/2020
                    Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
                    Orientador(es)
                    • Anamaria Mello Miranda Paniago
                    Coorientador(es)
                      Orientando(s)
                      • Adriana Carla Garcia Negri
                      Banca
                      • Anamaria Mello Miranda Paniago
                      • Everton Ferreira Lemos
                      • James Venturini
                      • Marcia de Souza Carvalho Melhem
                      • Mauricio Antonio Pompilio
                      • Ricardo de Souza Cavalcante
                      Resumo
                      PREVALÊNCIA DE TOXOPLASMA GONDII E NEOSPORA CANINUM EM AMOSTRAS DE GESTANTES
                      Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
                      Tipo Tese
                      Data 20/07/2020
                      Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
                      Orientador(es)
                      • Renato Andreotti e Silva
                      Coorientador(es)
                        Orientando(s)
                        • Pâmella Oliveira Duarte
                        Banca
                        • Eduardo de Castro Ferreira
                        • Everton Falcao de Oliveira
                        • Izaias Pereira da Costa
                        • Marcos Valério Garcia
                        • Renato Andreotti e Silva
                        • Sonia Maria Oliveira de Andrade
                        Resumo
                        PANORAMA DA TUBERCULOSE EM POPULAÇÕES PRIVADAS DE LIBERDADE E NOVOS DESAFIOS: UMA ABORDAGEM SOBRE PROFILAXIA PRIMÁRIA E CUSTO EFETIVIDADE PARA TRIAGEM EM MASSA
                        Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
                        Tipo Tese
                        Data 30/06/2020
                        Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
                        Orientador(es)
                        • Julio Henrique Rosa Croda
                        Coorientador(es)
                          Orientando(s)
                          • Roberto Dias de Oliveira
                          Banca
                          • Crhistinne Cavalheiro Maymone Goncalves
                          • Flávia Patussi Correia Sacchi
                          • Julio Henrique Rosa Croda
                          • Leonardo Martinez Pantoja
                          • Marli Marques
                          • Valeria Cavalcanti Rolla
                          Resumo
                          INFECÇÃO POR PAPILOMAVÍRUS HUMANO, GARDNERELLA VAGINALLIS E CHLAMYDIA TRACHOMATIS EM PACIENTES ATENDIDAS NO HOSPITAL DE AMOR, UNIDADE DE CAMPO GRANDE – MS
                          Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
                          Tipo Tese
                          Data 16/04/2020
                          Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
                          Orientador(es)
                          • Ines Aparecida Tozetti
                          Coorientador(es)
                            Orientando(s)
                            • Larissa Zatorre Almeida
                            Banca
                            • Adriane Cristina Bovo
                            • Alda Maria Teixeira Ferreira
                            • Cacilda Tezelli Junqueira Padovani
                            • Camila Mareti Bonin Jacob
                            • Ines Aparecida Tozetti
                            • Luana Silva Soares
                            Resumo
                            AVALIAÇÃO DO PERFIL DE RESISTÊNCIA A ACARICIDAS EM CARRAPATOS DE IMPORTÂNCIA NA SAÚDE PÚBLICA E DETECÇÃO MOLECULAR DE AGENTES PATOGÊNICOS NO ESTADO DE MATO GROSSO DO SUL
                            Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
                            Tipo Tese
                            Data 23/03/2020
                            Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
                            Orientador(es)
                            • Renato Andreotti e Silva
                            Coorientador(es)
                              Orientando(s)
                              • Leandro de Oliveira Souza Higa
                              Banca
                              • Alessandra Gutierrez de Oliveira
                              • Alexsandra Rodrigues de Mendonça Favacho
                              • Doroty Mesquita Dourado
                              • Eduardo de Castro Ferreira
                              • Renato Andreotti e Silva
                              • Robson Ferreira Cavalcante de Almeida
                              Resumo
                              DIAGNÓSTICO DE SEPSE NEONATAL TARDIA VALORIZANDO HEMOCULTURA, EXAMES LABORATORIAIS E REAÇÃO DE CADEIA DE POLIMERASE COM PRIMER UNIVERSAL
                              Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
                              Tipo Tese
                              Data 27/02/2020
                              Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
                              Orientador(es)
                              • Durval Batista Palhares
                              Coorientador(es)
                                Orientando(s)
                                • Kelly Lopes De Araujo Appel
                                Banca
                                • Almir de Sousa Martins
                                • Anna Maria Duarte Miglioli
                                • Debora Marchetti Chaves Thomaz
                                • Durval Batista Palhares
                                • Paula Cristhina Niz Xavier
                                • Petr Melnikov
                                Resumo
                                ESTUDO CLÍNICO-EPIDEMIOLÓGICO E MOLECULAR DOS AGENTES DA CRIPTOCOCOSE NO MATO GROSSO DO SUL
                                Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
                                Tipo Tese
                                Data 28/06/2019
                                Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
                                Orientador(es)
                                • Marilene Rodrigues Chang
                                Coorientador(es)
                                  Orientando(s)
                                  • Rosianne Assis de Sousa Tsujisaki
                                  Banca
                                  • Ana Paula da Costa Marques
                                  • Cassia Rejane Brito Leal
                                  • Eduardo de Castro Ferreira
                                  • Flábio Ribeiro de Araújo
                                  • Marilene Rodrigues Chang
                                  • Mirella Ferreira da Cunha Santos
                                  Resumo
                                  INFECÇÃO PELO VÍRUS DA LEUCEMIA DE CÉLULAS T HUMANAS TIPO 1 (HTLV-1) ENTRE IMIGRANTES JAPONESES E SEUS DESCENDENTES NO ESTADO DE SÃO PAULO
                                  Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
                                  Tipo Tese
                                  Data 25/06/2019
                                  Área MEDICINA
                                  Orientador(es)
                                  • Ana Rita Coimbra Motta de Castro
                                  Coorientador(es)
                                    Orientando(s)
                                    • Larissa Melo Bandeira
                                    Banca
                                    • Alda Maria Teixeira Ferreira
                                    • Ana Rita Coimbra Motta de Castro
                                    • Joao Americo Domingos
                                    • Jorge Simão do Rosário Casseb
                                    • Luana Silva Soares
                                    • Silvia Naomi de Oliveira Uehara
                                    Resumo
                                    Morcegos como possíveis reservatórios de Leishmania spp. em áreas endêmicas para as leishmanioses em Mato Grosso do Sul, Brasil.
                                    Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
                                    Tipo Tese
                                    Data 31/05/2019
                                    Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
                                    Orientador(es)
                                    • Eduardo de Castro Ferreira
                                    Coorientador(es)
                                      Orientando(s)
                                      • Ludiele Souza Castro
                                      Banca
                                      • Adriana de Oliveira Franca
                                      • Alda Izabel de Souza
                                      • Carina Elisei de Oliveira
                                      • Carolina Ferreira Santos
                                      • Celia Maria Ferreira Gontijo
                                      • Eduardo de Castro Ferreira
                                      Resumo
                                      Incidência de hepatite B: Uma visão geral histórica do impacto da cobertura vacinal contra hepatite B
                                      Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
                                      Tipo Tese
                                      Data 27/05/2019
                                      Área MEDICINA
                                      Orientador(es)
                                      • Rivaldo Venancio da Cunha
                                      Coorientador(es)
                                      • Silvia Naomi de Oliveira Uehara
                                      Orientando(s)
                                      • Eunice Stella Jardim Cury
                                      Banca
                                      • Alessandra Gutierrez de Oliveira
                                      • Ana Paula de Assis Sales
                                      • Ana Rita Coimbra Motta de Castro
                                      • Everton Ferreira Lemos
                                      • Luiza Helena de Oliveira Cazola
                                      • Rivaldo Venancio da Cunha
                                      Resumo
                                      Imunosenescência associada ao HIV: análise comparativa do fenótipo de linfócitos T circulantes
                                      Curso Doutorado em Doenças Infecciosas e Parasitárias
                                      Tipo Tese
                                      Data 29/03/2019
                                      Área DOENÇAS INFECCIOSAS E PARASITÁRIAS
                                      Orientador(es)
                                      • Ines Aparecida Tozetti
                                      Coorientador(es)
                                        Orientando(s)
                                        • Erivaldo Elias Júnior
                                        Banca
                                        • Andrea de Siqueira Campos Lindenberg
                                        • Cacilda Tezelli Junqueira Padovani
                                        • Camila Mareti Bonin Jacob
                                        • Ines Aparecida Tozetti
                                        • Luana Silva Soares
                                        • Vanessa Terezinha Gubert
                                        Resumo
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